L’idée d’une formation universitaire regroupant les Évangéliques vient des responsables de la Fédération des Églises et Mission Évangélique au Burkina Faso (FEME). Une étude préliminaire de la faisabilité fut menée, mais ses conclusions n’ont pas tout de suite été mises en application. En 2013, sous le leadership du pasteur Samuel Yaméogo, Dieu réveilla l’esprit des membres de l’équipe dirigeante qui reprendra le projet avec l’orientation telle qu’on la connaît aujourd’hui.

Des personnes ressources travailleront sur les programmes pour constituer le dossier de demande de création de l’université dénommé « Université Évangélique du Kadiogo ». En 2014 l’autorisation de création est obtenue. Dans la même année, l’autorisation de l’ouverture de trois filières est accordée. Le temple Emmanuel à Ouagadougou sis au 1200 logements mettra ses locaux à la disposition de la nouvelle université pour servir de salles de classe et de bureau à l’administration. Le professeur Jean Sakandé accompagnera l’équipe chargée de l’administration et des études pour la mise en route et la gestion des affaires courantes. Les filières théologie et sciences religieuses ouvriront leurs portes dès l’année académique 2017-2018.